以若尔盖高寒湿地为核心，辐射青藏高原及邻近地区典型湿地分布区，采用跨学科、跨部门的方式，以国家生态安全重大战略需求和世界湿地生态发展态势要求为导向，开展高寒湿地生态系统保护与可持续利用的监测、研究与试验示范工作。主要研究方向包括： 

　　（1）生物多样性与保育：系统开展生物多样性观测研究，研发生物多样性统计分析模型；解析生物多样性格局形成与演化的时空模式，解析区域生物多样性当今格局的维持机制与未来发展态势；解析珍稀物种的濒危机制，研发生物多样性保护技术，为区域生态文明建设提供理论支撑和技术指南。 

　　（2）物种形成与进化：采用全基因组学与生态学结合的手段，揭示区域物种分化和分布格局的形成机制，解析关键物种适应极端环境的微进化过程，进一步发展和完善物种形成和进化理论，为青藏高原及邻近地区的动植物保护和遗传资源的利用提供理论依据。 

　　（3）生态系统过程：综合采用野外原位监测、控制试验、模型模拟等手段，研究高寒湿地生态系统结构与功能特征，探索植物-动物相互作用及其对全球变化的响应与适应机制，揭示高寒湿地碳水循环过程对全球变化的反馈机制，为高寒湿地生态系统的保育提供科学依据。 

　　（4）区域生态保护与管理：综合自然及人文多学科知识，系统研究生态系统服务功能的形成与维持机制、恢复与保育技术、评估与管理方案；开展生态恢复应用示范和规划咨询；提升自然-社会生态系统韧性，为区域生态系统科学管理和可持续发展提供技术和政策支撑。 

　　（5）农牧业可持续发展：系统评价农牧区典型生态系统的环境特征及敏感性，筛选和培育适应性强的主导草种、主导畜种和农作物新品种，研发集成生态安全种植、养殖和草畜产品加工技术，开展农牧区政府部门技术人员培养和社区能力建设，创建若尔盖高寒湿地可持续发展模式，实现生态环境保护与产业发展双赢。