物种形成及物种界限（Speciation and Species boundary）的问题，是《Science》杂志2005年提出的125个重要科学问题之一，近年来受到了普遍的关注。物种（Species）做为生命的最基本单元，是生物多样性的最基本单位及组成部分。对物种的正确认识是生物多样性保护、可持续发展等多方面重要的前提和基础。但同时，物种也是复杂的、极具争议的。在过去一个世纪，针对物种概念（Species concept）的研究层出不穷，虽然已经有超过30个以上的不同物种概念的提出，生物学家至今在物种概念上仍存在分歧。在高等生物物种界定中，生殖隔离（reproductive isolation）被认为是一条基本的、具有可操作性的准则。在此基础上产生的生物学物种概念（Biological Species Concept, BSC）一直是高等生物物种界定最可靠的准则。生物学家认为，由于生殖隔离的存在，不同物种之间无法进行基因交流，以此维持物种的界限。 

 上世纪末以来，随着DNA测序技术的不断发展，越来越多的证据表明分类学上界定的不同物种之间存在基因交流。这种基因交流包括第一代测序就能展现的叶绿体捕获（chloroplast capture）再到如今高通量测序揭示的不同程度的基因渐渗（introgression）都表明物种与物种之间存在大量的杂交导致的基因交流现象。随着研究的深入和对象的扩展，这些打破生殖隔离而产生物种间基因流（gene flow）的实例越来越多，并且包含了大量的动植物。广泛存在的杂交导致的基因交换逐渐被认为是物种进化的动力之一。但是，在广泛存在的基因流背景下，物种如何维持自己的身份（identity）并保持与其他物种的界限是值得深入研究的问题。 

 中国科学院成都生物研究所生物多样性与生态功能服务领域植物标本馆课题组高云东副研究员，针对滇西北地区高海拔分布的百合属植物，选择了由沿海拔梯度分布的3种豹子花植物组成的杂交区（hybrid zone），通过群体遗传学建立谱系结构、生态位模拟揭示适应性差异以及开花物候差异统计花粉流方向几方面的研究，表明该杂交区内存在沿坡度向下的不对称基因流（asymmetry gene flow）。但是三个物种形态差异较大、并且不存在大量的中间过渡形态，表明在基因流背景下物种的界限得到了很好的维持。该研究标明物种的开花物候、种子传播方式决定了基因流的方向；生态位之间的差异导致的环境过滤（environment filtering）对适宜分布区外的物种及其杂交后代的剔除效应是物种界限维持的机制。最后，百合属植物巨大的染色体及由此导致的极低的重组率也可能是物种维持“关键基因”（e.g., genome island）不被交换的原因。这些结果表明物种是动态的、变化的，自然环境（自然选择）与基因重组的相互作用是物种进化的动力之一。 

 该项研究以Hybrid speciation and introgression both underlie the genetic structures and evolutionary relationships ofthree morphologically distinct species of Lilium (Liliaceae) forming a hybrid zone along an elevational gradient 为题目发表在植物学国际期刊Frontiers in Plant Science（JCR - Plant Science, 19/234）上。该研究得到国家自然科学基金（项目号31500163, 31770406）以及中国科学院战略资源专项（项目号KFJ-BRP-017-17）的支持。 

 原文链接 

　　图1. 研究涉及的三种百合属植物。a-b. 贡山豹子花Lilium gonshanense (Y.D. Gao et X.J. He) Y.D. Gao，c-d. 多斑豹子花L. meleagrinium (Franchet) Y.D. Gao,，e-f. 云南豹子花L. saluenense (Balf. f.) S.Y. Liang，g-h. 杂交区内出现的杂交子代（Putative hybrid F2）。 

　　图2. 梯度杂交区三个物种的群体遗传结构。a. 基于叶绿体的结果；b. 基于核基因微卫星分子标记（SSR）的结果。