2010.09—2014.07 西华大学 化学  理学学士

2014.09—2017.07 四川大学化学学院 分析化学   理学博士

2018.09—2021.12 四川大学化学学院 分析化学   理学博士

2022.05—2025.1 四川大学华西医院   博士后

围绕人工智能驱动的药物研发全链条，聚焦以下方向：

1. 靶点结构导向的分子/多肽生成

发展基于靶蛋白三维结构的深度生成模型，实现小分子及多肽药物的从头设计与活性优化。

2. 千亿级全模态超大规模虚拟筛选平台

构建覆盖小分子与多肽的千亿级化合物库高效筛选系统，融合多模态/多尺度数据，提升先导物发现效率。

3. 多智能体协作的药物设计与优化平台

基于多智能体强化学习与协同决策，实现药物分子的智能化多目标迭代优化。

4. 重大疾病（尤其炎症/免疫）的系统性AI药物研发

针对炎症及重大免疫疾病，整合靶点识别、先导物发现、成药性评估，形成“干湿结合、多轮迭代”的闭环优化模式，加速从计算到验证的转化。

考虑靶蛋白活性口袋电场效应的扩散分子生成模型及其应用研究；2025.1.1-2027.12.31；国家自然科学基金青年项目C类；主持

基于蛋白3D结构采样的分子生成模型的研究与应用； 2024.1.1-2025.12.31；四川省青年基金；主持

基于深度学习的3D药物分子从头设计算法和应用 2025.1.1至2027.12.31；博士后面上项目二等；主持

基于人工智能的新型 PROTAC分子的从头设计合成与活性研究 2023.1.1-2024.12.31；四川大学博士后交叉学科创新基金；主持

基于新一代AI技术的候选新药发现研究；2023.11-2026.10  ；国家重点研发计划；项目骨干

针对四种与神经系统疾病相关GPCR靶标的小分子拮抗剂的发现和疾病干预探索；2026.1.1-2029.12.31；国家自然科学基金重点项目；参与

1)  Zhenyu Yang^#, Weining Sun^#, Qiao Huang^#, Yueyue Li^#, Meng Yuan, Yu Yang, Heng Zhao, Zheyi Liu, Xiaoxi Zeng, Fangjun Wang, Yuanyuan Jiang*, Yi Zhao*, Runsheng Chen*. Deep learning-assisted discovery of a potent and cell-active inhibitor of RNA N6-methyladenosine recognition protein YTHDC2. Nat. Commun. 2026, 17, 46.

2)  Zhenyu Yang^#, Kai Wang^#, Guo Zhang^#, Yuanyuan Jiang^#, Rui Zeng, Jingxin Qiao, Yueyue Li, Xinyue Deng, Ziyi Xia, Rui Yao, Xiaoxi Zeng, Liyun Zhang, Yi Zhao*, Jian Lei*, Runsheng Chen*. A deep learning model for structure-based bioactivity optimization and its application in the bioactivity optimization of a SARS-CoV-2 main protease inhibitor. European Journal of Medicinal Chemistry, 2025, 291, 117602.

3)  Yuanyuan Jiang^#, Guo Zhang^#, Jing You^#, Hailin Zhang^#, Rui Yao^#, Huanzhang Xie, Liyun Zhang, Ziyi Xia, Mengzhe Dai, Yunjie Wu, Linli Li, Shengyong Yang*. PocketFlow is a data-and-knowledge-driven structure-based molecular generative model. Nat Mach Intell, 2024, 6, 326–337.

4)  Yuanyuan Jiang, Zongwei Yang, Jiali Guo, Hongzhen Li, Yijing Liu, Yanzhi Guo, Menglong Li, Xuemei Pu*. Coupling complementary strategy to flexible graph neural network for quick discovery of coformer in diverse co-crystal materials. Nat. Commun. 2021, 12, 5950.

5)  Yuanyuan Jiang, Yuan Yuan, Xi Zhang, Tao Liang, Yanzhi Guo, Menglong Li, Xumei Pu*. Use of network model to explore dynamic and allosteric properties of three GPCR homodimers. RSC Adv., 2016, 6, 106327-106339.