- 李家堂
- 职 务：所长
- 电子邮件：lijt@cib.ac.cn
- 职 称：研究员
- 学 历：博士研究生
- 通讯地址：四川省成都市天府新区群贤南街23号
- 邮 编：610213
个人简历
中国科学院成都生物研究所研究员，博士生导师。国家杰出青年基金、国家优秀青年基金、中国动物学会青年科技奖、中国科学院卢嘉锡青年人才奖、中国科学院青年创新促进会优秀会员和四川省学术和技术带头人获得者；任中国动物学会两栖爬行动物学分会副主任委员、青年生命论坛理事长、中国动物学会理事和四川省动物学会副理事长；《Zoological Research》和《The Innovation》编委，《National Science Review》学科编辑组成员。以长期野外科考为基础，系统开展了两栖爬行动物多样性与进化研究。近年来重点围绕蛇类开展如下工作：解析了水游蛇科等类群全球分布格局演变；揭示了蛇类对高原、森林和海洋环境的适应策略；探究了体色、蛇类身体延长和四肢缺失等性状的分子机制。以第一或通讯（含共同）在Cell（封面论文），PNAS（3篇，1篇为封面论文），Science Advances，Nature Communications，National Science Review，Cell Reports，Genome Biology（Featured Article），Molecular Biology and Evolution，Briefings in Bioinformatics等刊物发表高水平论文；出版专著一部。研究成果推动了国际蛇类进化基因组学的发展，得到美国系统生物学家David Hillis院士等同行专家高度评价，并被Science杂志News栏目专题报道。在蛇类物种多样性、时空格局与进化方面取得了系列成果，传承、拓展并推动了两栖爬行动物学研究，对解析生命起源与进化具有重要意义。
教育经历
2000年9月-2004年7月，聊城大学生命科学学院，获理学学士学位；
2004年9月-2009年7月，四川大学生命科学学院和中国科学院昆明动物研究所，获理学博士学位，导师：赵尔宓院士，张亚平院士。
科研与学术工作经历
2009年9月-2015年3月，中国科学院昆明动物研究所，博士后，合作导师：张亚平院士；
2010年5月-2012年9月，中国科学院成都生物研究所，助理研究员；
2012年10月-2014年11月，中国科学院成都生物研究所，副研究员；
2014年12月-2017年12月，中国科学院成都生物研究所，青年研究员；
2015年11月-2016年11月，美国德克萨斯州立大学奥斯汀分校，访问学者；合作导师：David M. Hillis 院士；
2018年1月-至今，中国科学院成都生物研究所，研究员。
研究方向
1.动物多样性前沿与仿生
开展物种多样性挖掘、系统演化与保护生物学研究，聚焦物种演化机制、大尺度生物地理学等关键科学问题，探究物种分布格局的时空动态规律，揭示生物多样性形成与维持机制。基于蛇类红外感知等特殊功能，多学科交叉探讨其背后的特有结构重塑机制和神经传导机理，开展仿生利用，服务于国家需求。
2.性状解析与演化医学
以演化医学为新视角，聚焦动物关键性状的演化创新，建立玉米蛇和鬃狮蜥等爬行动物发育研究体系，结合基因编辑技术和分子功能实验等，开展大尺度、跨物种的比较分析，系统解析动物关键性状背后的遗传创新机制与调控网络，揭示其对人类相关疾病的机理启示，服务人民生命健康。
3.蛇毒功能发掘和先导分子开发
聚焦蛇毒等动物毒素资源，结合人工智能、结构生物学与合成生物学等手段，解析关键毒素的作用靶点及机制，筛选并改造为具有抗血栓、抗菌及生物农药活性的先导分子，推动心血管疾病防治、耐药菌感染控制与绿色生物农药创制等，服务国家重大需求。
社会任职
2010年-至今，《Asian Herpetological Research》，Editor
2020年-至今，《The Innovation》，Academic Editor
2021年-至今，《Zoological Research》，Associate Editor
2021年-至今，《Diversity》，Editor
2022年-至今，《National Science Review》, Editorial Group Member
2021年-至今，中国动物学会两栖爬行学分会，副主任委员
2025年-至今，中国遗传学会动物遗传委员会，副主任委员
获奖及荣誉
主持了第八届世界两栖爬行动物学大会“Taxonomy Systematics Phylogenetics”分会场报告；2019年和2021年分别受邀在“中国动物学会两栖爬行动物学分会”和“亚欧两栖爬行动物多样性与保护国际学术大会”做大会报告；作为青年生命论坛理事长，在2019-2022年分别在乌鲁木齐、武汉、北京和广州组织召开了四届青年生命论坛，取得良好社会反响。
获中国科学院卢嘉锡青年人才奖（2014）、第六届中国动物学会青年科技奖（2015）、中国科学院青年创新促进会优秀会员（2018）、四川省青年科技奖（2018）、四川省天府万人计划（2019）、四川省学术和技术带头人（2021）、四川省杰出青年科技人才（2020）、2023年度四川十大科学进展（2023）、中国动物学会长隆奖（2024）、国务院特殊津贴（2024）、蓉城英才计划（领军）（2024）。
基于研究成果积极推动科普教育活动：与中国国际电视台（CGTN）合作拍摄生物多样性纪录片《多样之境》（西藏温泉蛇），获北京国际电影节短视频单元知识类二等奖，并得到联合国生物多样性公约秘书处推荐；基于不同大陆板块生物扩散规律和树栖适应性演化研究成果制作的科普视频获“2019年全国优秀科普微视频一等奖”（科技部与中国科学院办公厅）、“2022年全国优秀科普微视频作品” （科技部与中国科学院办公厅）和“2022年四川省优秀科普微视频”一等奖（四川省科技厅）
承担科研项目情况
1. 国家自然科学基金委员会，杰出青年基金项目，32325011，蛇类多样性与进化，2024-01至2028-12，400万元，在研，主持。
2. 国家自然科学基金委员会，重点国际（地区）合作研究项目，32220103004，蛇类红外感应器官的进化遗传机制研究，2023-01至2027-12，235万元，在研，主持。
3. 科技部，第二次青藏高原综合科学考察研究项目课题，2019QZKK0501，近50年来气候变化和人类活动对高原脊椎动物多样性的影响，2019-11至2024-10，1600万元，主持。
4. 中国科学院，战略性先导科技专项（B类）课题，XDB31000000，种内适应策略及其分子机制，2018-07至2023-06，2117万元，主持。
5. 国家自然科学基金委员会，优秀青年基金项目，31722049，两栖爬行动物系统学，2018-01至2020-12，130万元，主持。
代表论著
1. Lv Yun-yun#, Wu Wei#, Ren Jin-Long, Matthew K. Fujita, Song Meng-Huan, Wang Zeng, Jiang Ke , Jiang De-Chun, Yan Chao-Chao, Peng Chang-Jun, Peng Zhong-Liang, Li Jia-Tang*. Genomic insights into evolution of parthenogenesis and triploidy in the flowerpot snake. Science Advances, 2025, 11(14): eadt6477.IF5year =14.100.
2. Yan Chao-Chao#, Li Xin-Ning#, Peng Zhong-Liang, Wu Wei, Wang Zeng, Zhu Zhao-Ran, Liu Jia-Chang, Wang Yao, Ren Jin-Long, Zhang Zhi-Yi*, Li Jia-Tang*. Hologenomics Reveals Specialized Dietary Adaptations in the Mengla Snail-Eating Snake. Advanced Science, 2025, 12(40): e09999. (封面论文). IF5year=15.600.
3. Peng Changjun#, Wu Dong-Dong#, Ren Jin-Long#, Peng Zhong-Liang, Ma Zhifei, Wu Wei, Lv Yunyun, Wang Zeng, Deng Cao, Jiang Ke, Parkinson Christopher, Qi Yin, Zhang Zhi-Yi, Li Jia-Tang*. Large-scale snake genome analyses provide insights into vertebrate development. Cell, 2023, 186: 1-18. (封面论文). IF5year =57.499.
4. Tang Chenyang#, Zhang Xiaohu#, Xu Xiao#, Sun Shijie, Peng Changjun, Song Meng-Huan, Yan Chaochao, Sun Huaqin, Liu Mingfeng, Xie Liang, Luo Shu-Jin, Li Jia-Tang*. Genetic mapping and molecular mechanism behind color variation in the Asian vine snakie. Genome Biology, 2023, 24: 46. (Featured Article). IF5year=17.400.
5. Yan Chaochao#, Wu Wei#, Dong Wenqi#, Zhu Bicheng, Chang Jiang, Lv Yunyun, Yang Shilong, Li Jia-Tang*. Temperature acclimation in hot-spring snakes and the convergence of cold response. The Innovation, 2022, 3(5): 100295. IF5year=32.100.
6. Zhang Zhi-Yi, Lv Yunyun, Wu Wei, Yan Chaochao, Tang Chen-Yang, Peng Changjun, Li Jia-Tang*. The structural and functional divergence of a neglected three-finger toxin subfamily in lethal elapids. Cell Reports, 2022, 40, 111079. IF5year=9.900.
7. Wu Wei#, Gao Yue-Dong#, Jiang De-Chun#, Lei Juan, Ren Jin-Long, Liao Wen-Bo, Deng Cao, Wang Zeng, Hillis David M.*, Zhang Ya-Ping*, Li Jia-Tang*. Genomic adaptations for arboreal locomotion in Asian flying treefrogs. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2022, 119(13), e2116342119. (封面论文) IF5year=12.000.
8. Song Meng-Huan, Yan Chaochao, Li Jia-Tang*. MEANGS: an efficient seed-free tool for de novo assembling animal mitochondrial genome using whole genome NGS data. Briefings in Bioinformatics, 2021, bbab538. IF5year=10.600.
9. Peng Changjun, Ren Jin-Long, Deng Cao, Jiang Dechun, Wang Jichao, Qu Jiangyong, Chang Jiang, Yan Chaochao, Jiang Ke, Murphy Robert W., Wu Dong-Dong*, Li Jia-Tang*. The genome of Shaw’s sea snake (Hydrophis curtus) reveals secondary adaptation to its marine environment. Molecular Biology and Evolution, 2020, 37(6):1744–1760. IF5year=15.100.
10. Jiang Dechun#, Klaus Sebastian#, Zhang Ya-Ping, Hillis David M., Li Jia-Tang*. Asymmetric biotic interchange across the Bering Land Bridge between Eurasia and North America. National Science Review, 2019, 6(4):739–745. IF5year=22.300.
11. Li Jia-Tang#*, Gao Yue-Dong#, Xie Liang#, Deng Cao, Shi Peng, Guan Meng-Long, Huang Song, Ren Jin-Long, Wu Dong-Dong, Ding Li, Huang Zi-Yan, Nie Hu, Humphreys Devon P., Hillis David M*, Wang Wen-Zhi*, Zhang Ya-Ping*. Comparative genomic investigation of high-elevation adaptation in ectothermic snakes. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2018, 115(33):8406–8411. IF5year=12.000.
12. Klaus Sebastian*, Morley Robert J., Plath Martin, Zhang Ya-Ping, Li Jia-Tang*. Biotic interchange between the Indian subcontinent and mainland Asia through time. Nature Communications, 2016, 7(4):12132. IF5year=17.000.
13. Li Jia-Tang*, Li Yang, Klaus Sebastian, Rao Ding-Qi, Hillis David M.*, Zhang Ya-Ping*. Diversification of rhacophorid frogs provides evidence for accelerated faunal exchange between India and Eurasia during the Oligocene. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2013, 110:3441–3446. IF5year=12.000.
14. 王跃招, 蔡波, 李家堂.《中国生物多样性红色名录 脊椎动物 第三卷 爬行动物》. 科学出版社, 2021, ISBN 978-7-03-068399-1.
第三方评价
图1. 蛇类起源与演化相关研究成果以封面论文形式发表于Cell并被Science杂志News栏目报道
图2. Science杂志News栏目报道研究团队温泉蛇系列研究成果
图3. 温泉蛇高原适应性演化研究被Science Foundation in China评为Research Highlights
图4. 中央电视台以“我国科学家首次揭示温泉蛇基因组”为题进行了专题报道
图5. 温泉蛇研究被中国科学报报道
图6. 绿瘦蛇体色多态性分子机制工作被Genome Biology杂志选为Featured Article
在官网首页专栏介绍
图7. 银环蛇神经毒素基因的演化相关工作被TheScientist和ScienceX等媒体报道
图9. 印度次大陆和欧亚大陆生物扩散规律的相关研究成果发表于PNAS，受到美国系统生物学家David Hillis 院士的高度评价：“The paper provides strong evidence in favor of hypotheses for two rounds of faunal exchange”，并被 Nature China 评为 Research Highlights.
图10.基于研究成果积极推动科普教育活动，获“全国优秀科普微视频一等奖”（科技部与中科院办公厅）、“全国优秀科普微视频作品” （科技部与中科院办公厅）和“四川省优秀科普微视频”一等奖（四川省科技厅）等，并获联合国生物多样性公约秘书处推荐
图11. 基于长期野外科考，发表多个新属和新种，推动了公众对生物多样性保护的认知
图12：中央电视台以“我国科学家揭开钩盲蛇孤雌进化之谜”为题进行了专题报道
